Заповедник находится на территории Усть-Коксинского района Республики Алтай. Он расположен в самой высокогорной части Алтая - на Катунском хребте. Площадь заповедника 151 тыс. га. К территории заповедника прилегает Гора Белуха (4 506 м) - самая высокая точка Сибири, объект Всемирного природного наследия ЮНЕСКО. Заповедник расположен на высотах от 1300 до 3280 м. В его пределах распространены высокогорья с крупными ледниками, снежниками и каменистыми россыпями и среднегорья с тундрами, альпийскими и субальпийскими лугами. По глубоко врезанным долинам рек и в нижних частях склонов господствуют лесные сообщества.

Территория заповедника повсеместно изменена древними и современными ледниками, деятельность которых зафиксирована в островершинных пиках, карах, корытообразных троговых долинах с множеством озер. Здесь расположен один из самых мощных центров современного оледенения на Алтае.

В заповеднике берет начало одна из крупнейших рек Алтая - Катунь. Все реки заповедника относятся к ее бассейну и имеют горный характер с большими уклонами. В заповеднике насчитывается 135 живописных озер, происхождение которых связано с работой древних ледников.

Климат этой горной территории континентальный, с высокими годовыми и суточными амплитудами температур. Зимой здесь солнечно, безветренно и морозно (ср температура января -21…-230С), летом существенное влияние оказывают циклоны, ср температура июля в высокогорьях колеблется от+4 до +60С, а долинах - +15…+170С. Годовое количество осадков достигает 1000-1500 мм. Зимой здесь накапливается значительное количество снега.

Общие сведения | Физико-географическое расположение | Природа | Устойчивое развитие | Научные исследования| Штат заповедника | Отдел охраны | Эколого-просветительский отдел | Эколого-познавательные туристические маршруты